Die Direktorin leitet die Studienakademie. Sie nimmt die ihr vom Sächsischen Hochschulgesetz und der Rektorin oder dem Rektor übertragenen Aufgaben wahr. Sie ist zuständig für alle Angelegenheiten der Studienakademie und trifft alle Entscheidungen in fachlichen und organisatorischen Angelegenheiten der Studienakademie. Die Direktorin führt den Vorsitz im Studienakademierat, vollzieht dessen Beschlüsse und ist ihm verantwortlich. 

Die Direktorin der DHSN am Standort Bautzen ist Frau Prof. Dr. Katharina Bühn.

Die Studienakademie Bautzen hat zwei Prodirektoren. Die Prodirektoren wurde vom Studienakademierat gewählt. 
Die Amtszeit endet spätestens mit der Amtszeit der Direktorin.  

Prodirektor und Stellvertreter der Direktorin der DHSN am Standort in Bautzen ist Herr Prof. Dr. Alexander Flory.

Prodirektor der DHSN am Standort in Bautzen ist Herr Prof. Dr. Martin Seilmayer.

Korrespondenzen, Organisations- und Kommunikationsaufgaben, Terminplanungen und Terminüberwachungen, Protokollführung in Beratungen und Sitzungen unter der Leitung der Direktion u.a. Verwaltungsaufgaben übernimmt das Sekretariat der Direktion.

Das Sekretariat der Direktion am Standort Bautzen leitet Frau Andrea Buhl.